СМЦ ФМБА России зарегистрировано в Едином государственном реестре юридических лиц за основным государственным регистрационным номером 1026401414830 Межрайонной инспекцией Федеральной налоговой службы №2 по Саратовской области 11 декабря 2002 года. Учредителем является Федеральное управление медико-биологических и экстремальных проблем при Министерстве здравоохранения Российской Федерации